Родилась 15 февраля 1951 г. в деревне Лаборовая Приуральского района Ямало-Ненецкого автономного округа Тюменской области. В 1970 г. окончила среднюю школу-интернат в посёлке Аксарка Приуральского района и поступила на геологоразведочный факультет Тюменского индустриального института (на тот момент единственная ненка в вузе). По состоянию здоровья окончила лишь два курса. Во время учебы в институте начала писать стихи.
В 1972 г. познакомилась с председателем Тюменской областной писательской организации К. Я. Лагуновым. Почувствовав в молодой ненке незаурядный, самобытный талант, Константин Яковлевич взял ее под опеку — наставлял в творчестве, поддерживал в сложных жизненных ситуациях: помогал с лечением, устроил на работу, помог решить жилищный вопрос. В 1975—1976 гг. Неркаги работала методистом в Тюменском областном управлении культуры. В это время написаны повести о людях тундры, о делах и людях Заполярья. В 1976 г. журнал «Урал» опубликовал первую повесть писательницы — «Анико из рода Ного», которая получила высокую оценку на шестом всесоюзном совещании молодых писателей. Через год повесть напечатали в издательстве «Молодая гвардия» стотысячным тиражом. В 1978 г. Анна Павловна была принята в Союз писателей СССР. В 1979 г. в журнале «Урал» вышла вторая повесть Неркаги «Илир». Во время работы над третьей книгой «Белый ягель» (книга была экранизирована в 2014 г. реж. Владимиром Меньшовым) поехала в творческую командировку в тундру, в родное Заполярье, и неожиданно для всех осталась там навсегда. Работала в бригаде оленеводов, возглавляла культурно-массовую работу. В 1996 г. тюменское издательство «СофтДизайн» тиражом десять тысяч экземпляров выпустило один из самых известных сборников повестей книгу «Молчащий». В 2014 г. издана книга Анны Павловны «Мудрые изречения ненецкого народа: Собрание мудрых мыслей, советов, правил и предостережений на кочевой дороге Жизни». В ней изложены взгляды, отражающие духовность ненецкого народа. В небольших по объёму новеллах, адресованных широкому кругу читателей, но по-прежнему своим детям.
В настоящее время Анна Неркаги живёт и работает на родном для неё Полярном Урале, в фактории Лаборовая, на северо-западе Ямало-Ненецкого округа. Лауреат многих литературных премий. Почётный гражданин Ямало-Ненецкого автономного округа.